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Nel 2005 viene scoperto il "Pianeta G", potenzialmente abitabile, e a Oahu viene costruito un sistema di comunicazione per raggiungere qualsiasi forma di vita extraterrestre. Lì, Alex Hopper viene arrestato mentre cerca di fare colpo su Sam Shane, figlia dell'ammiraglio Terrance Shane. Il fratello di Alex, il Comandante Stone Hopper, costringe Alex a unirsi alla Marina degli Stati Uniti. Sette anni dopo, Alex è un tenente a bordo della USS John Paul Jones e ha una relazione con Sam, una fisioterapista che lavora con i veterani feriti. Mentre Stone è un ufficiale modello al comando della USS Sampson, la ribelle Alex rischia un congedo disciplinare.

Durante l'esercitazione RIMPAC del 2012, arrivano cinque navicelle aliene. La loro nave per le comunicazioni colpisce un satellite e si schianta contro la Bank of China Tower di Hong Kong, mentre le altre precipitano nelle acque al largo delle Hawaii. Sampson, John Paul Jones e il cacciatorpediniere giapponese JDS Myōkō scoprono una struttura galleggiante che genera uno scudo di forza che isola le isole Hawaii e i tre cacciatorpedinieri dal resto del mondo e blocca tutti i radar e le comunicazioni all'interno. Tre navi da guerra aliene salgono in superficie e aprono il fuoco; la Myōkō viene distrutta, la Sampson viene persa con tutti gli uomini, compreso Stone, e l'equipaggio di comando della John Paul Jones viene ucciso, con Alex che assume a malincuore il comando. La John Paul Jones si sgancia per recuperare i sopravvissuti della Myōkō, tra cui il capitano Yugi Nagata, mentre i droni alieni distruggono le installazioni militari e le strade di Oahu, ignorando tutti gli obiettivi che non rappresentano una minaccia.

Durante un'escursione nei pressi dell'array di comunicazione, Sam e il tenente colonnello dell'esercito americano in pensione e doppio amputato Mick Canales scoprono la presenza degli alieni. Incontrano lo scienziato Cal Zapata e capiscono che gli alieni hanno preso il controllo dell'array per ristabilire le comunicazioni con il loro pianeta natale. L'equipaggio di John Paul Jones cattura un alieno che si collega telepaticamente con Alex, rivelando la loro storia di distruzione di mondi. Altri alieni recuperano il loro compagno mentre un altro sabota la nave. La sua tuta corazzata si rivela impenetrabile al fuoco delle armi leggere, ma viene distrutta dal cannone da 5 pollici del cacciatorpediniere e il casco dell'alieno catturato rivela che i suoi occhi sono sensibili alla luce del sole. A terra, Sam, Nick e Zapata recuperano il suo analizzatore di spettro e lo usano per comunicare via radio a John Paul Jones che gli alieni contatteranno il loro pianeta quando il satellite della struttura sarà in posizione tra quattro ore.

Al calar della notte, il capitano Nagata suggerisce di utilizzare le boe di allarme tsunami della National Oceanic and Atmospheric Administration intorno alle Hawaii per seguire le navi da guerra senza radar, permettendo a John Paul Jones di distruggerne due. La terza si rivela troppo sfuggente, così la attirano verso est al sorgere del sole. Alex e Nagata sparano alle finestre del ponte, accecando l'equipaggio con la luce del sole mentre John Paul Jones distrugge la nave. Il cacciatorpediniere tenta di colpire il sistema di comunicazione, ma viene affondato dai droni; Alex, Nagata e molti altri marinai si salvano per un pelo.

I sopravvissuti requisiscono la nave da guerra dismessa della Seconda Guerra Mondiale USS Missouri con l'aiuto di veterani in pensione. La struttura galleggiante si rivela essere una gigantesca nave madre, ma la Missouri disattiva il campo di forza mentre l'ammiraglio Shane convoca i caccia della portaerei USS Ronald Reagan. La torretta della corazzata che trasportava l'ultimo proiettile della nave viene disattivata, costringendo i marinai a trasportarlo in un altro sistema d'arma. Sam, Mick e Cal bloccano gli alieni presso il sistema, dove Mick uccide un soldato alieno. Alex usa l'ultimo proiettile per distruggere l'array, rendendo il Missouri indifeso, ma i droni della nave madre vengono distrutti dai caccia Boeing F/A-18 della Royal Australian Air Force che bombardano a tappeto la nave madre, eliminando la minaccia aliena.

Alex viene promosso tenente comandante e riceve una Stella d'Argento e la Croce della Marina postuma del fratello. L'ammiraglio Shane promette ad Alex che presto avrà una nave tutta sua e lo invita a diventare un Navy SEAL. Alex gli chiede la mano di Sam e l'ammiraglio inizialmente rifiuta, ma invita Alex a pranzo.