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Dopo la fine della Seconda Guerra Mondiale, il responsabile dell'Olocausto Adolf Eichmann scompare; altri leader della Germania nazista si tolgono la vita per evitare di essere processati per crimini di guerra. Nel 1954, l'agente del Mossad Peter Malkin uccide per errore la persona sbagliata mentre dà la caccia a un criminale di guerra nazista in Austria, danneggiando la sua reputazione.

A Buenos Aires, in Argentina, nel 1960, Sylvia Hermann inizia a corteggiare il figlio di Adolf Eichmann, Klaus. A cena con il padre tedesco-ebraico di lei, Lothar, Klaus parla apertamente in modo negativo degli ebrei e afferma che suo padre è morto in guerra. Lothar si insospettisce e comunica il suo nome al Mossad di Tel Aviv, in Israele. L'agente Zvi Aharoni viene inviato a Buenos Aires per iniziare la ricognizione. Klaus porta Sylvia a una riunione che si rivela essere un revival nazista guidato da Carlos Fuldner, a cui partecipa anche Eichmann. Sylvia se ne va bruscamente dopo che gli invitati esplodono in un canto Sieg Heil.

Ora che lavora in coordinamento con il Mossad, Sylvia incontra la famiglia Eichmann nella loro casa con il pretesto di riconciliarsi con Klaus. Una discussione tra lei e Klaus provoca l'intervento di Eichmann (che vive sotto il nome di Ricardo Klement e sostiene di essere lo zio di Klaus); Klaus lo chiama accidentalmente suo padre ed Eichmann viene successivamente fotografato da un agente del Mossad. Eichmann si accorge che l'agente sta scattando la sua foto e lo ritrae.

Il team del Mossad utilizza le prove dell'incontro per confermare l'identità di Eichmann e pianificare la sua cattura: intendono travestirsi da equipaggio aereo di El Al e portarlo via mentre è sedato. Peter e la sua ex fidanzata Hanna, un medico, entrano a far parte della squadra con il compito di tenere Eichmann sedato durante il viaggio. La squadra si coordina e cattura Eichmann fuori da casa sua. Mentre la sua famiglia e i suoi amici cercano di capire se la sua scomparsa sia dovuta alla scoperta della sua vera identità, Eichmann ammette la sua identità ai suoi rapitori. Nel frattempo, gli agenti apprendono che il loro volo di ritorno è stato ritardato di dieci giorni. Inoltre, vengono informati che la compagnia aerea non accetterà di trasportare Eichmann a meno che non firmi una dichiarazione giurata in cui afferma di voler andare in Israele; Eichmann si rifiuta di firmare perché non crede che avrà un processo equo. L'interrogatore della squadra non riesce a comunicare con Eichmann e le tensioni tra i membri della squadra aumentano: alcuni vorrebbero uccidere Eichmann. Alla fine Peter ottiene la firma dopo aver raccontato la storia personale della perdita della sorella Fruma e dei suoi tre figli piccoli a causa dell'Olocausto e dopo aver ascoltato la storia di Eichmann che affermava di non essere a conoscenza dell'effettiva uccisione degli ebrei, sostenendo che il suo lavoro si concentrava esclusivamente sulla logistica e che stava solo "seguendo gli ordini".

Durante il ritardo dell'aereo e in attesa della capitolazione di Eichmann, Klaus e la polizia indagano sempre più sulla scomparsa di Eichmann, diffondendo l'identikit dell'agente operativo al pubblico. Dopo aver utilizzato dollari americani al posto dei pesos argentini, uno dei contatti locali del Mossad viene catturato e torturato fino a quando non rivela la posizione del rifugio. Mentre la squadra del Mossad si prepara a partire, Eichmann abbandona la sua facciata educata e racconta a Peter la storia orribile di aver assistito all'uccisione di 5.000 ebrei in una fossa da parte delle Einsatzgruppen, chiedendosi crudelmente ad alta voce se uno di loro (una donna che aveva implorato Eichmann di salvare il suo bambino) fosse la sorella di Peter.

Con i nazisti e la polizia alle calcagna, il resto della squadra è costretto a modificare drasticamente il piano di fuga, con il risultato che due agenti devono essere lasciati indietro. La polizia confisca anche i permessi di atterraggio dell'aereo, bloccandolo a terra. Peter consegna una copia del permesso al controllo del traffico aereo e, vedendo la polizia avvicinarsi, ordina all'aereo di decollare senza di lui.

In Israele, tutti gli agenti si riuniscono al processo di Eichmann, che viene trasmesso in tutto il mondo. Nell'epilogo, si scopre che Eichmann viene dichiarato colpevole e impiccato nel 1962. La testimonianza dei sopravvissuti alla macchina di morte nazista durante il processo è stata la prima volta che il mondo ha sentito parlare direttamente da loro. Peter ha una carriera di successo e una lunga vita e muore nel 2005.