Un giovane arrivato negli Stati Uniti dopo l'incidente della Shinmiyangyo del 1871 ritorna in Corea in un momento storico per la nazione e s'innamora di una nobildonna.
Mr. Sunshine è incentrato su Eugene Choi (Lee Byung-hun), nato in schiavitù a Joseon. Dopo essere fuggito negli Stati Uniti in seguito allo Shinmiyangyo del 1871, diventa un ufficiale del Corpo dei Marines.
Quando torna a Joseon per una missione, Eugene incontra e si innamora della nipote di un aristocratico, Go Ae-shin (Kim Tae-ri), che fa parte dell'Esercito dei Giusti. Tuttavia, il loro amore è messo a dura prova dalle loro diverse classi sociali e dalla presenza di Kim Hui-seong (Byun Yo-han), un nobile che è stato il promesso sposo di Ae-shin fin dall'infanzia. Eugene incontra anche Goo Dong-mae (Yoo Yeon-seok), uno spietato samurai, e Kudo Hina (Kim Min-jung), proprietaria del famoso "Glory Hotel" dove Eugene alloggia. Allo stesso tempo, Eugene scopre un complotto dell'Impero del Giappone per colonizzare la Corea e si trova presto coinvolto nella lotta per la sovranità di Joseon.
A differenza della maggior parte dei drammi di Sageuk che trattano dell'occupazione giapponese della Corea, Mr. Sunshine si svolge prima dell'annessione giapponese, tra la fine del XIX e l'inizio del XX secolo. Si concentra molto sull'Esercito dei Giusti e descrive la vita delle persone che hanno combattuto per la libertà di Joseon. Vengono rappresentati o citati eventi storici reali come lo Shinmiyangyo, la guerra ispano-americana, l'assassinio dell'imperatrice Myeongseong, la guerra russo-giapponese, l'abdicazione forzata di Gojong e la battaglia di Namdaemun.
Personaggi storici come l'imperatore Gojong, Ito Hirobumi, Hayashi Gonsuke, Yoshimichi Hasegawa, Horace Newton Allen e i Cinque Traditori di Eulsa appaiono come personaggi ricorrenti, mentre altri, come Theodore Roosevelt, Ahn Chang-ho, Sunheon, Park Seung-hwan e Frederick Arthur MacKenzie, fanno anche dei cameo.
Joseon si oppone all'incursione degli Stati Uniti. Yoo-jin sopravvive in America... come Eugene. Ae-shin sa che è in atto un grande cambiamento con ramificazioni globali.