I Puffi - Viaggio nella foresta segreta vede Puffetta e i suoi fratelli attraversare l'inesplorata Foresta Incantata per cercare di scoprire il favoloso villaggio dei Puffi prima che lo faccia la loro nemesi, il malvagio mago Gargamella. Lungo il percorso, alcuni dei misteri delle origini dei Puffi vengono portati alla luce.
Smurfs: The Lost Village è stato presentato in anteprima il 2 aprile 2017 ed è uscito negli Stati Uniti il 7 aprile 2017 con recensioni contrastanti da parte della critica e del pubblico (anche se alcuni lo considerano un miglioramento rispetto ai due film precedenti) e ha incassato oltre 197 milioni di dollari in tutto il mondo a fronte di un budget di 60 milioni di dollari. Il film è stato dedicato a Jonathan Winters, la voce di Grande Puffo nella serie originale, morto nel 2013, Anton Yelchin, la voce di Puffo Maldestro, e Nine Culliford, moglie di Peyo, entrambi morti nel 2016.
Una serie televisiva sequel stand-alone prodotta da Dupuis Édition & Audiovisuel senza il coinvolgimento di Sony, I Puffi, ha debuttato in Belgio nel 2021.
Nel Villaggio dei Puffi, i Puffi vivono pacificamente tra di loro e con il loro capo Grande Puffo. Tra i Puffi ci sono anche Puffo Maldestro, Puffo Cervellone, Puffo Peloso e Puffetta, che è stata creata dal malvagio mago Gargamella da un pezzo di argilla, ma è stata riscattata da Grande Puffo ed è entrata a far parte del villaggio; tuttavia, sente di non adattarsi e cerca di trovare il suo scopo nella vita, come fanno gli altri Puffi. Nel frattempo, Gargamella ha come missione quella di catturare i Puffi, rubare tutta la loro essenza e diventare il mago più potente del mondo.
Un giorno, durante una gita in barca, Puffetta scopre una possibile creatura puffa, ma viene catturata da Gargamella e portata nel suo castello. Lì, rivela accidentalmente un cappello che la creatura ha lasciato cadere, consentendo a Gargamella di creare un infuso che gli permette di localizzare il villaggio su una mappa. Ben presto Furbo, Cervellone e Maldestro aiutano Puffetta a fuggire e tornano al Villaggio dei Puffi, dove Grande Puffo li confina nelle loro case come punizione per aver quasi disobbedito ai suoi ordini, respingendo le loro affermazioni sull'esistenza di un altro villaggio dei Puffi. Tuttavia, Puffetta esce di nascosto per cercare il villaggio perduto e Brainy, Clumsy e Hefty si uniscono a lei, ma Gargamella li scopre subito mentre cercano di trovare il villaggio e si dirige con il suo gatto Azrael e il suo avvoltoio Monty per fermarli.
I quattro seguono la mappa e finiscono per vivere varie avventure e incontrare creature bizzarre, tra cui una colonia di libellule sputafuoco e un labirinto di caverne, da cui alla fine riescono a fuggire con l'aiuto di un branco di conigli verdi luminosi. Alla fine, i quattro Puffi raggiungono un fiume dove navigano su una zattera artigianale per raggiungere il villaggio perduto, solo per incontrare nuovamente Gargamella, Azrael e Monty. Dopo un breve inseguimento, Gargamella viene gettato fuori dalla sua stessa zattera e i Puffi lo salvano. Tuttavia, invece di ringraziarli, li spinge fuori dalla loro stessa zattera, lasciandoli precipitare in una cascata.
Tuttavia, mentre Puffetta, Brainy, Hefty e Clumsy strisciano su una spiaggia, si scopre che hanno salvato Gargamella solo perché lo zaino di Brainy è rovinato.
I quattro vengono presto catturati dalle creature ricoperte di foglie che si rivelano essere Puffi femmina. Vengono portati a Smurfy Grove dove incontrano Puffo Tempesta, Puffo Fiore, Puffo Giglio (il puffo di prima), Puffo Melodia e il loro capo Puffo Salice, che danno il benvenuto ai Puffi nella loro umile casa. Puffo Tempesta e Maldestro si allontanano dal villaggio per trovare Gargamella e avvisare gli altri. Durante il viaggio, Clumsy rivela che Puffetta è stata creata da Gargamella, cosa che porta Puffo Tempesta a diffidare di Puffetta. Gargamella, che è stato condotto in una palude infestata da piranha, e Azrael avvistano Clumsy e Tempesta di Puffi e li fanno attaccare da Monty, ma questi volano via per tornare al villaggio.
Dopo un tour del villaggio, Puffetta inizia ad abituarsi alla vita nel Bosco dei Puffi, con grande disappunto di Hefty e Brainy. Tempesta di Puffi e Maldestro tornano rivelando che Puffetta è stata creata da Gargamella. I Puffi femmina preparano un attacco quella notte ma, al posto di Gargamella, arriva Grande Puffo che, avendo scoperto l'assenza del quartetto, li riporta a casa e i Puffi femmina lo accettano nella loro casa. Purtroppo Gargamella, Azrael e Monty invadono improvvisamente e distruggono Puffolandia, catturando tutti i Puffi. Tuttavia, Puffetta viene risparmiata perché Gargamella ha notato che non è un vero Puffo e quindi non gli è più utile e se ne vanno. Sentendosi affranta per le sue azioni, Puffetta riceve una foto di se stessa con i suoi amici e, dopo aver capito cosa significa davvero non essere un vero Puffo, torna nella tana di Gargamella per salvare i suoi compagni Puffi.
Nella tana di Gargamella, Brainy prepara un piano per fuggire, che Grande Puffo e Puffo Salice accettano. Hefty, Brainy, Clumsy e alcuni Puffi femmina riescono a portare a termine il piano finché Gargamella e Azrael non li individuano e mettono Clumsy e altri Puffi femmina nel suo Smurfilator, una macchina in grado di estrarre la loro essenza. Ma prima che il piano vada a buon fine, Puffetta arriva e inganna Gargamella facendogli credere di voler tornare a essere un Puffo cattivo. Soddisfatto della sua falsa dichiarazione, Gargamella cerca di trasformare Puffetta in un Puffo malvagio, solo per rendersi conto che Puffetta sta assorbendo i suoi poteri magici, al punto che la tana esplode, facendo volare lui, Azrael e Monty nel lago dei piranha. I Puffi vengono liberati ma, nonostante la vittoria, Puffetta è tornata ad essere un pezzo di argilla senza vita.
Tornati al Villaggio dei Puffi, i Puffi fanno una commemorazione per Puffetta e piangono silenziosamente la sua perdita, con Grande Puffo che la definisce il Puffo più vero di tutti. Per fortuna, la loro energia e il loro amore per Puffetta l'hanno riportata in vita. Tutti, compreso il Villaggio dei Puffi, si rallegrano del fatto che Puffetta era un vero puffo blu.
Durante i titoli di coda, Gargamella, Azrael e Monty tornano alla loro tana e Gargamella incolpa ingiustamente Azrael di aver rovinato i suoi piani invece della sua stessa idiozia, rivelando così l'adozione di Azrael, mentre cerca di fermare la musica e i titoli di coda.